# 土壤微生物组管理服务

诊断与调控土壤微生物组的商业服务——基于 DNA 的土壤检测、AI 病害风险与养分循环模型、田间微生物生物量检测以及微生物改良剂处方，提升肥料效率并抑制土传病害。

Source: https://cn.bioecon.ru/technology/soil-microbiome-management-services/
Updated: 2026-08-18



## 概览与价值链

标记：[EC: EU Soil Monitoring Law & Farm to Fork | OECD: Agricultural Biotechnology | Regulator: EPA（美国）, EFSA（欧盟）, MoA（中国）]

土壤微生物组管理服务诊断并主动调控生活在农业土壤中的细菌、
真菌、古菌与线虫——这一群落驱动养分循环、土传病害抑制与肥料
效率。土壤承载了地球上约 59% 的生命，而现代高通量 DNA
元条形码技术比形态学鉴定能多检出 27.5–32.5% 的线虫属（在柑橘
与石榴果园中为 40–43 对 29），使活体土壤在大规模上可被测量。
Biome Makers 的 BeCrop 4.0 引擎可针对超过 44 550 个真菌物种进行
DNA 赋值，参照库涵盖来自 20 个国家的 5 000 多份土壤样品，而
Trace Genomics 的测序覆盖 70 种作物和 225+ 种土传病原体。该
品类涵盖 DNA 诊断、AI 病害风险预测、田间微生物生物量检测以及
微生物改良剂处方。

土壤微生物组管理服务的关键方向：
1. **基于 DNA 的土壤微生物组诊断（DNA-Based Soil Microbiome Diagnostics）：** 对土壤细菌、真菌、古菌与病原体进行高通量测序与元条形码分析——Trace Genomics 的 TraceCOMPLETE 与 Biome Makers 的 BeCrop。
2. **AI 病害风险与土壤健康建模（AI Disease-Risk & Soil-Health Modeling）：** 机器学习工具将 DNA 与农场管理数据转化为病害风险与养分循环评分，如 Bioclear earth 的病害易感性预测器与 BeCrop 的 AL 助手。
3. **田间生物检测（Field-Deployable Biology Assays）：** 约 20 分钟即可给出微生物生物量与真菌/细菌比的现场快检，加上手持式养分扫描仪（AgroCares）提供当日土壤化学数据。
4. **微生物改良剂处方（Microbial Amendment Prescription）：** 依据诊断施用微生物菌剂与土壤调理剂（Genliduo 的 菌碳 菌剂、Kingenta 的生物肥料），抑制土传病害并重建土壤生物群落。

### 行业价值链

```
[土壤采样] ──> [DNA 与田间分析] ──> [AI 风险剖析] ──> [处方]
                            │
                    (指导土壤管理)
                            │
                            ▼
[监测] <─── [微生物改良] <─────┘
```

### 价值链层级

| 层级 | 描述 | 关键投入/产出 |
|:---|:---|:---|
| **Soil Sampling** | 在田间采集带地理坐标的土芯 | **输入：** 田块、GPS、采样方案。**输出：** 标准化土壤样品。 |
| **DNA & Field Analysis** | NGS 测序加手持式微生物与养分扫描 | **输入：** 土壤样品、试剂。**输出：** 测序与化学数据。 |
| **AI Risk Profiling** | 机器学习模型评估病害风险、养分循环与生物多样性 | **输入：** 测序数据、管理记录。**输出：** 土壤健康指数。 |
| **Prescription** | 将指数转化为投入与管理建议 | **输入：** 风险评分、作物方案。**输出：** 改良剂处方。 |
| **Microbial Amendment** | 施用微生物菌剂、调理剂与生物肥料 | **输入：** 处方、微生物产品。**输出：** 改良后土壤。 |
| **Monitoring & Advisory** | 跨季节复测并就土壤健康轨迹提供咨询 | **输入：** 时序检测数据。**输出：** 经验证的恢复、咨询建议。 |

行业横切技术：
- **新一代 DNA 测序（NGS Soil Profiling）：** 元条形码与鸟枪法宏基因组学，从单个土芯刻画细菌、真菌、古菌与线虫。
- **AI 土壤健康建模（AI Soil-Health Modeling）：** 基于 DNA 与农场管理数据训练的病害风险与养分循环预测。
- **田间微生物生物量检测（Field Microbial-Biomass Assays）：** 在实验室周转过慢时，提供现场快速微生物生物量与真菌/细菌比检测。

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## 美国

美国在基于 DNA 的土壤诊断与预测性病原体管理方面领先，依托基因组学平台与深厚的农学服务基础。

### DNA soil diagnostics, predictive pathogen platforms, USDA soil-health programs
- **Trace Genomics：** 高分辨率基因组测序覆盖 70 种作物和 225+ 种土传病原体，以 TraceCOMPLETE、TracePHOS 和 TraceN 销售；其位于艾奥瓦州埃姆斯的分析实验室与知识产权于 2025 年 7 月被 Miraterra（不列颠哥伦比亚省温哥华）收购，以将土壤 DNA 与拉曼光谱结合。
- **Biome Makers：** BeCrop 4.0（2026 年 2 月发布）在 DNA 赋值扩展 30% 后可识别 44 550+ 个真菌物种，参照库涵盖 20 个国家的 5 000+ 份土壤样品；BeCrop Farm 评估 1 000+ 项参数，并已验证 400+ 种生物投入产品。
- **USDA/EPA 框架：** 土壤施用微生物产品按 EPA 生物农药路径登记，而 USDA-NRCS 的土壤健康项目拉动了对检测与咨询服务的商业需求。

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## 中国

中国将大型本土微生物菌剂与土壤调理剂产业与 MARA 的生物肥料登记框架相结合，置于“藏粮于地、藏粮于技”的国家战略之下。

### microbial inoculants, soil-conditioner industry, MARA registration
- **Genliduo（根力多）：** 成立于 2002 年的微生物菌剂专业企业，以“菌碳”（微生物+碳）核心技术为基础；麦玉保 等产品抑制土传病原菌（全蚀病、根腐病、纹枯病）并加速秸秆腐熟，并牵头制定了《含微生物有机无机复合肥料》团体标准。
- **Kingenta（金正大）：** 成立于 1998 年，在深圳上市（002470），是全球最大的缓控释肥生产商，年产能 600 万吨，资产 87 亿元，员工 8000 人；三度荣获国家科技奖，是联合国粮农组织全球土壤合作伙伴成员，于 2025 年 4 月在荷兰开设了首个欧洲缓控释肥示范工厂。
- **MARA 登记路径：** 微生物菌剂与生物肥料按 MARA 生物肥料路径上市，构成了土壤微生物组服务产品的市场路径。

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## 欧盟

欧盟将计算型土壤生物学板块与新的欧盟土壤监测法及 Farm to Fork 框架相结合，为可测量的土壤健康服务创造直接需求。

### NGS soil DNA advisory, handheld soil scanning, EU Soil Monitoring Law
- **Bioclear earth（格罗宁根，荷兰）：** 成立于 1988 年；采用新一代测序刻画土壤细菌、真菌与古菌，并基于农场管理数据训练 AI 工具预测土壤对作物病害的易感性，与格罗宁根、弗里斯兰和德伦特省合作开展耕作土壤健康工作。
- **AgroCares（荷兰）：** 手持式 Scanner 以 freemium 云端模式提供现场土壤养分（N/P/K）与健康分析，以快速的田间化学检测补充 DNA 诊断。
- **欧盟土壤监测法：** 新的土壤健康框架将服务需求与可测量的土壤状态指标挂钩，而 EFSA 负责评估进入欧盟市场的微生物性状产品。

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## 领先企业与研究机构

| 企业 / 机构 | 国家 | 关键产品 / 平台 | 技术特征 | 2026 状态 |
|:---|:---|:---|:---|:---|
| **Trace Genomics** | 🇺🇸 美国 | *TraceCOMPLETE 土壤 DNA* | 70 种作物、225+ 病原体（Miraterra 旗下） | Commercial |
| **Biome Makers** | 🇺🇸 美国 | *BeCrop 土壤微生物组检测* | 44 550 个真菌物种、5 000+ 样品 / 20 国 | Operating |
| **AgroCares** | 🇳🇱 荷兰 | *手持式土壤扫描仪* | 现场 N/P/K + 土壤健康，freemium 云端 | Commercial |
| **Bioclear earth** | 🇳🇱 荷兰 | *土壤健康 DNA 咨询* | NGS + AI 病害易感性预测（自 1988） | Operating |
| **Genliduo** | 🇨🇳 中国 | *微生物菌剂（菌碳）* | 微生物+碳技术，抑制土传病害 | Commercial |
| **Kingenta** | 🇨🇳 中国 | *土壤调理剂 + 生物肥料* | 全球最大缓控释肥企业（002470.SZ） | Commercial |

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## 技术栈与创新

该技术栈将基于 DNA 的诊断与 AI 土壤健康建模及田间检测与改良剂层相结合。

1. **基于 DNA 的土壤微生物组诊断（DNA-Based Soil Microbiome Diagnostics）：**
   - Trace Genomics 运用高分辨率基因组测序，从单次送检即可刻画覆盖 70 种作物与 225+ 病原体的土壤生物与病原体。
   - Biome Makers 的 BeCrop 4.0 引擎将 DNA 赋值扩展 30%，可识别超过 44 550 个真菌物种，参照库涵盖 5 000+ 份样品、20 个国家。
2. **AI 土壤健康与病害风险建模（AI Soil-Health & Disease-Risk Modeling）：**
   - Bioclear earth 基于细菌、真菌与古菌的 NGS 谱，结合农场管理数据训练 AI 工具，预测土壤对作物病害的易感性。
   - Biome Makers 的 AL 助手将通路与养分循环指标转化为氮（六条微生物途径）、磷和钾的管理指导。
3. **田间检测与微生物改良（Field Assays & Microbial Amendments）：**
   - 现场快检约 20 分钟给出微生物生物量与真菌/细菌比，而 AgroCares 的手持扫描仪在实验室周转过慢时补充当日 N/P/K 化学数据。
   - 微生物改良剂——Genliduo 的 菌碳 菌剂与 Kingenta 的土壤调理剂及生物肥料——依据诊断施用，抑制土传病害并重建土壤生物群落。

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## 价值链与生产流程

### 土壤微生物组管理服务的工业流程（ISO 17025 检测 / MARA 生物肥料登记）

```
┌───────────────────────────┐      ┌───────────────────────────┐
│ 1. 土壤采样               │ ───> │ 2. DNA 与田间分析         │
└───────────────────────────┘      └───────────────────────────┘
                                                  │
                                                  ▼
┌───────────────────────────┐      ┌───────────────────────────┐
│ 4. 处方                   │ <─── │ 3. AI 风险剖析            │
└───────────────────────────┘      └───────────────────────────┘
               │
               ▼
┌───────────────────────────┐      ┌───────────────────────────┐
│ 5. 微生物改良             │ ───> │ 6. 监测与咨询             │
└───────────────────────────┘      └───────────────────────────┘
```

#### 阶段 1：土壤采样
按标准化方案在田间采集带地理坐标的土芯（BeCrop 约每公顷一份样品）；产出为一组可比的土壤样品。

#### 阶段 2：DNA 与田间分析
NGS 元条形码刻画细菌、真菌、古菌与线虫——高通量测序比形态学鉴定多检出 27.5–32.5% 的线虫属——并辅以手持式养分扫描；产出为测序与化学数据。

#### 阶段 3：AI 风险剖析
机器学习模型依据 DNA 数据与农场管理记录评估病害风险、养分循环与生物多样性（BeCrop Farm 的 1 000+ 项参数；Bioclear earth 的病害易感性 AI）；产出一组土壤健康指数与风险评分。

#### 阶段 4：处方
将指数转化为品牌中立的投入与管理建议——在何处部署生物肥料、调理剂或养分释放剂——形成与作物方案挂钩的改良剂处方。

#### 阶段 5：微生物改良
施用微生物菌剂、调理剂与生物肥料（Genliduo 的 菌碳 系列、Kingenta 的土壤调理剂与生物肥料组合），依据诊断发挥作用，抑制土传病害并重建土壤生物群落。

#### 阶段 6：监测与咨询
跨季节复测土壤以追踪土壤健康轨迹，以经验证的恢复与持续咨询闭合循环，并对接欧盟土壤监测法的土壤状态指标。

